バイオインフォマティクス

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2016年度講義予定表(前期火曜1限)

4月12日 配列アライメント(五斗) [講義資料PDF 小テスト問題]
4月19日 データベースサーチ(五斗) [講義資料PDF 小テスト問題]
4月26日 休講
5月10日 機能・構造予測(五斗) [講義資料PDF 小テスト問題]
5月17日 配列モチーフ・隠れマルコフモデル(五斗) [講義資料PDF 小テスト問題]
5月24日 アセンブリとマッピング(Blanc-Mathieu) [講義資料PDF 小テスト問題(パスワード付き)]
5月31日 分子進化(緒方) [講義資料PDF 小テスト問題(パスワード付き)]
6月 7日 分子系統解析(緒方) [講義資料PDF 小テスト問題(パスワード付き)]
6月14日 分子系統解析【演習】(Blanc-Mathieu) [講義資料PDF(パスワード付き)]
6月21日 遺伝子予測(緒方) [講義資料PDF 小テスト問題(パスワード付き)]
6月28日 機能アノテーション、比較ゲノム(緒方) [講義資料PDF(パスワード付き)]
7月 5日 機能アノテーション、比較ゲノム2(緒方) [講義資料PDF 小テスト問題(パスワード付き)]
7月12日 システムズバイオロジー【演習】(五斗)
(KEGGによる機能アノテーション比較)[講義資料PDF]
7月19日  メタゲノム解析(緒方) [講義資料PDF 小テスト問題(パスワード付き)]

さらに興味のある人はゲノム情報解析の演習ケミカル情報解析の演習も参考にして下さい。

場所

6号館304号室302号室、演習は6号館208209号室(学術情報メディアセンター端末室)。
!!!講義室が302、演習室が209に変更になりましたのでご注意下さい!!!

成績

成績は平常点(複数回の小レポートを含む)で評価します。

参考書

  • 日本バイオインフォマティクス学会編「バイオインフォマティクス入門」慶應義塾大学出版会
  • 金久實「ポストゲノム情報への招待」共立出版
    • 英語版:M. Kanehisa, "Post-genome Informatics", Oxford University Press
  • 藤博幸(編)「はじめてのバイオインフォマティクス」講談社
  • D. W. Mount, "Bioinformatics: Sequence and genome analysis", Cold Spring Harbor Laboratory Press
    • 日本語版「バイオインフォマティクス ゲノム解析から機能解析へ(第2版)」
  • A. ポランスキ, M. キンメル「バイオインフォマティクス」(後藤修訳) 丸善
  • 阿久津達也「バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム」共立出版
  • 藤博幸「タンパク質機能解析のためのバイオインフォマティクス」講談社
  • 金久實(編)「ゲノムネットのデータベース利用法(第3版)」共立出版

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最終更新日:2016年7月25日